Nuovi kit e nuovo flusso di lavoro per la proteomica del plasma e del siero di LC

Diamo ai nostri clienti nel campo delle scienze della vita la possibilità di stabilire conoscenze biologiche attraverso soluzioni efficienti e affidabili e flussi di lavoro che stabiliscono lo standard per l'analisi delle proteine. Il nostro spirito di squadra, energia e impegno...

HOUSTON, TX — All'ASMS 2023, PreOmics GmbH annuncia il lancio dei suoi nuovi kit ENRICH-iST™, che consentono un arricchimento biologicamente imparziale di proteine ​​plasmatiche e sieriche meno abbondanti su particelle paramagnetiche non funzionalizzate, migliorando di 50 gradi la profondità tipica dell'analisi proteomica del plasma. percentuale fino a oltre il 100%, rispetto alla proteomica del plasma o del siero puro senza deplezione o arricchimento. Il nuovo flusso di lavoro ENRICH-iST consente l'elaborazione rapida e affidabile di un massimo di 96 campioni di plasma in parallelo per la ricerca e la validazione riproducibile traslazionale e clinica su larga scala. Il conveniente flusso di lavoro di arricchimento di routine ENRICH-iST integra perfettamente i flussi di lavoro di ricerca esistenti sulla scoperta della proteomica del plasma ultraprofondo che utilizzano l'esaurimento automatizzato delle sfere o l'arricchimento di array di nanoparticelle.

La tecnologia ENRICH-iST offre una soluzione semplice, veloce (<5 ore in totale) ed economica per l'elaborazione di campioni proteomici di plasma o siero di varie specie, inclusi esseri umani, roditori, NHP, cani e maiali. Richiedendo solo 20 microL di materiale di partenza, fornisce costantemente risultati riproducibili e migliorati per l'analisi LC-MS, ad esempio mediante spettrometria di massa DIA-PASEF timsTOF 4D Proteomics. Utilizzando microsfere paramagnetiche non funzionalizzate, la tecnologia consente un arricchimento biologicamente imparziale di proteine ​​meno abbondanti e supporta piattaforme di automazione della gestione dei liquidi, come i sistemi Tecan FLUENT.

Il Dr. Andreas-David Brunner, Drug Discovery Sciences, Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG, afferma: "Lavoriamo abitualmente con coorti di biofluidi raccolti da specie precliniche. La nuova tecnologia ENRICH di PreOmics ci ha permesso di ottenere risultati proteomici affidabili e approfonditi dati senza un laborioso sviluppo del metodo. Il nuovo kit ha funzionato immediatamente; il flusso di lavoro è intuitivo e può essere completamente automatizzato. Questa soluzione ci consente di standardizzare completamente i nostri processi e migliora significativamente la nostra produttività."

In uno studio di riferimento, campioni di plasma e siero provenienti da campioni umani, di topo e di ratto (dai fornitori Sigma Aldrich, BioIVT e Diaserve Laboratories GmbH) sono stati elaborati utilizzando il nuovo flusso di lavoro ENRICH-iST rispetto alla deplezione basata sugli anticorpi, nonché ai campioni puri non trattati. I peptidi sono stati analizzati su uno spettrometro di massa timsTOF HT (Bruker Daltonics) in modalità DIA-PASEF utilizzando un gradiente nanoLC di 30 minuti. È stato dimostrato che il flusso di lavoro ENRICH-iST aumenta la profondità proteomica di peptidi e proteine ​​di 1,5 – 2,2 volte rispetto ai campioni puri. I coefficienti di variazione (CV) tipici all'interno delle repliche erano inferiori al 12%, sottolineando l'elevata ripetibilità del flusso di lavoro ENRICH-iST. L'abbinamento delle proteine ​​identificate con il database dei proteomi plasmatici ha rivelato una copertura superiore per il flusso di lavoro ENRICH-iST rispetto ai campioni puri e impoveriti con proteine ​​identificate che coprivano un intervallo dinamico più ampio. ENRICH-iST ha mostrato una maggiore precisione nell'intervallo di abbondanza misurato rispetto al flusso di lavoro di esaurimento.

La Dott.ssa Catherine Nury, Manager Proteomics, Philip Morris International, Svizzera, commenta: "Abbiamo testato diverse opzioni per la scoperta di biomarcatori su campioni di plasma, ma molte si sono rivelate lunghe e noiose. Con la nuova tecnologia ENRICH, disponiamo di un metodo veloce, efficiente e affidabile flusso di lavoro di arricchimento per approfondire il proteoma del plasma e del siero umani. Utilizziamo i kit ENRICH-iST 96x e siamo entusiasti della riproducibilità e della facilità del kit. Ci è davvero piaciuto lavorare con il team PreOmics, che è sempre lì per supportarci Consigliamo vivamente il kit ad altri utenti di proteomica del plasma e del siero."

L'automazione è fondamentale per la proteomica del plasma ad alto rendimento e Luca Valeggia, Senior Vice President—Lab Automation, presso Tecan, aggiunge: "Siamo lieti di continuare la nostra collaborazione con PreOmics. Automatizzando il loro nuovo kit ENRICH-iST sulla nostra workstation Fluent, possiamo stanno consentendo una preparazione dei campioni ad alto rendimento robusta e riproducibile per studi di coorte di grandi dimensioni, contribuendo ad accelerare ulteriormente i progressi in questo campo in rapido progresso."